Det var första kvartsfinalen i bäst av tre matcher som spelades under onsdagskvällen.
Och efter två mållösa perioder hittade Linköpings Alvin Munther rätt när han spräckte Alexander Hellnemos nolla efter 41.12 minuters spel.
Men AIK skulle hitta en väg tillbaka när Adrian Zetterberg fixade 1–1-kvitteringen, framspelad av Tim Barkemo, med 2.40 kvar av ordinarie matchtid.
Den första kvartsfinalen gick därefter till förlängning. Den fjärde perioden blev dock ytterst kort då Alexander Dahlgren sköt 2–1 redan efter 14 sekunder.
1–0 i matcher till Linköping när serien vänder upp till Skellefteå. Match två på fredag och en eventuell avgörande match tre på lördag – också i Skellefteå.
FAKTA
Linköping–Skellefteå AIK 2–1 (0–0, 0–0, 1–1, 1–0)
Mål AIK: Adrian Zetterberg.
Skott: 30–29.
Utv-min: 4–6.
Publik: 500.
* 1–0 i matcher till LHC i J20-slutspelets kvartsfinal, som spelas bäst av tre.