Hemmalaget ledde med 2-0 i paus, och resultatet stod sig matchen ut.
I Boden blev Adam Johnson och Emmanuel Swedi målgörare, med ett mål var.
För hemmalaget betyder resultatet tredje plats i tabellen. Skellefteå är på elfte plats.
Nästa motstånd för Skellefteå är Piteå. Lagen möts torsdag 3 september 19.00 på Electrolux Home Arena.