Segern var Skellefteå FF:s fjärde på de senaste fem matcherna.
Målgörare för Skellefteå FF var Linus Almqvist och William Ögren, medan Bergnäsets enda mål gjordes av Precious Idodo Johnson.
För Bergnäset gör resultatet att man nu ligger på tionde plats i tabellen, medan Skellefteå FF är på åttonde plats.
Nästa motstånd för Skellefteå FF är Frösö IF. Lagen möts lördag 16 oktober 13.00 på Länsförsäkringar AC.