Ieltsin Jeronimo Semedo Camoes och Jonathan Käller gjorde Skellefteå FF:s mål, medan Kevin Appiah Nyarko 2, Danny Harmon, Cheikoumar Manuel Watt Ndongo och Jonathan Powell stod för gästernas målgörande.
Skellefteå FF har tre vinster, en oavgjord och en förlust på de senaste fem matcherna, medan Gottne har fyra vinster och en förlust.
Skellefteå FF:s nya tabellposition är femte plats, medan Gottne är på tredje plats.
Skellefteå FF tar sig an Umeå FC i nästa match borta lördag 18 juni 14.00.