"Det var inget lätt beslut att fatta men jag har bestämt mig för att gå vidare och koncentrera mig fullt ut på mitt jobb i Västerås SK", säger han i ett pressmeddelande.
Carlsson, som tillträdde i april 2019, väljer att inte förlänga kontraktet som går ut i april.
Anders Bergström, ordförande i landslagskommittén, säger att processen med att hitta herrlandslagets nya förbundskapten redan är i gång.
"Ja, det arbetet inleds omedelbart samtidigt som vi vill tacka Micke för ett fint arbete som vi tyvärr inte fick skörda frukten av på grund av pandemin som gjort att mästerskapen blivit inställda", säger han i pressmeddelandet.