Christian Scales och William Hoare nätade för hemmalaget, medan Adam Johnson blev tvåmålsskytt för gästerna.
Det här betyder att Skellefteå ligger på fjärde plats i tabellen, och Gottne är på sjätte plats.
I nästa omgång har Skellefteå Anundsjö borta på Olympia, lördag 25 maj 14.00.