Marcus Sylvegård, Sandro Schmid, Jacob Hallberg och Anton Jellvik blev målskyttarna för Malmö, medan Ludvig Stenvall, Oscar Nilsson och Kenneth Gulbrandsen gjorde Skellefteås mål.
Resultaten i sista omgången betyder att Malmö slutar på sjätte plats i tabellen.
Söndag 3 mars spelar Malmö hemma mot Timrå 11.00 och Skellefteå mot Rögle borta 11.30 i Lindab Arena.