Övriga mål för hemmalaget gjordes av Saj Chaichop och Linda Wänelöf.
Resultatet innebär att Gammelstad nu har fyra förluster i rad.
Båda lagen har haft en tuff start på säsongen. Malmberget tog nu sin första seger och Gammelstad är helt utan poäng efter fyra spelade matcher.
I nästa match möter Malmberget Kiruna FF borta på onsdag 6 juni 19.00. Gammelstad möter Kiruna FF söndag 3 juni 13.00 hemma.