Ingen "byter bort sitt öde mot majskakor", skriver hon i en kolumn i statliga tidningen Rodong Sinmun där hon kallar förslaget för dåraktigt.
Kim, som är en av de mäktigaste i sin brors regering, anklagar i texten Seoul för att återvinna gamla förslag som Nordkorea redan avvisat.
Nordkorea genomförde sitt senaste robottest på onsdagen, vilket fick Sydkoreas president Yoon Suk-Yeol att be grannen att återvända till förhandlingsbordet. Han hade ett par dagar tidigare föreslagit ett ekonomiskt stödpaket till Nordkorea om landet vidtog åtgärder för att avveckla sitt kärnvapen- och robotprogram.
Sydkoreas återföreningsdepartement beklagar Kim Yo Jongs kommentar.
– Den här attityden från Nordkorea kommer inte bara att hota freden på Koreahalvön utan resultera i fortsatta svårigheter för Nord genom att förvärra dess internationella isolering och ekonomiska situation, säger talespersonen Lee Hyo-Jung i ett uttalande.