Tio av de döda var fångvakter och säkerhetspersonal.
Angriparna anlände i pansarfordon. Ett okänt antal gärningsmän deltog i angreppet. 13 personer ska också ha skadats i slagsmål som utbröt efter attacken mellan fångar från rivaliserande gäng och drogkarteller.
24 intagna kunde fly i samband med attacken.
Enligt åklagarna har fyra personer gripits med det är inte klart om det handlar om intagna på fängelset eller angripare.
Gränsdelstaten Chihuahua, där Ciudad Juarez ligger, är svårt drabbad av kartellvåld.