Gripandet på tisdagen genomfördes dagen efter det att regeringen infört nya regler för att bekämpa vad den kallar religiös radikalisering.
Den gripne, Azath Salley, frihetsberövades i samband med en utredning av ett självmordsdåd som utfördes påsken 2019. Polis misstänker en lokal militant islamistisk extremistgrupp för dådet då 279 personer dödades.
– Han har gripits i enlighet med förordnandet om att förhindra terrorism, säger polisens talesperson Ajith Rohana.
Salley, som tidigare varit provinsguvernör, förargade myndigheter i förra veckan då han sade att han skulle följa sharialagar och inte lankesiska lagar.
President Gotabaya Rajapaksa meddelade också i helgen att personer som misstänks för "våldshandlingar eller religiösa, rasistiska och samhälleliga utspel . . . som skapar fientlighet mellan grupper" ska gripas.