Den japanska kustbevakningen började sökarbetet när kvinnans vän slog larm på måndagskvällen.
På onsdagsmorgonen, 37 timmar senare, hittades kvinnan åtta mil ut i havet av ett lastfartyg. Två besättningsmän hoppade i vattnet för att rädda henne, varpå kustbevakningens helikopter flög henne till land.
Kvinnan berättar att hon inte hade kunnat simma tillbaka till stranden eftersom hon simmade i en badring och vattnet förde henne allt längre bort från land.
Hon var något uttorkad, men i övrigt vid god hälsa och behövde inte stanna på det lokala sjukhus där hon undersöktes efter att ha blivit räddad.
Kustbevakningen meddelar att 21-åringen hade tur som överlevde, trots risker för värmeslag, sänkt kroppstemperatur på natten och för att bli påkörd av ett fartyg i mörkret.