Polisen fick in samtal om händelsen vid 01:25. Målsäganden är en kvinna, enligt polisen.
Ingen misstänkt är gripen eller frihetsberövad i nuläget.
– Det är sedvanliga utredningsåtgärder som vidtagits. Platsen är avspärrad och en teknisk brottsplatsundersökning ska genomföras under lördagen, säger polisens kommunikatör Maria Linné.
Ett intensivt utredningsarbete pågår, enligt polisen.
Hur gammal den utsatta kvinnan är eller om det varit en eller flera gärningsmän, vill polisen inte kommentera i nuläget.
Ett vittne som passerade platsen vid 03-tiden berättar:
– Det var avspärrat vid Kyrkbron från ”skogsdungen” som är bakom busskuren på Teg sidan. Avspärrning och flertal polisbilar och även poliser med hund som letade längst älven och in i området längst Fågelstigen.
Under lördagsförmiddagen var den tekniska undersökningen klar och avspärrningen hävd.
– Vi misstänker att det är utomhus och att det är på den plats som vi haft avspärrad. Mycket mer än så kan vi inte säga i nuläget. Vi har så många vittnen och även målsäganden som vi ska höra för att kunna bilda oss en uppfattning om vad som hänt. Just nu måste vi vara väldigt fåordiga, säger Fredrik Brink, polisens jourhavande förundersökningsledare.
Vet ni om det är en kvinna som blivit överfallen av en för henne okänd person eller har hon haft kontakt tidigare under kvällen med gärningsmannen?
– Det är oklart just nu. Vi vet inte hur de har hamnat där eller om de kände varandra sedan tidigare. Vi håller på att utreda det, säger Fredrik Brink.