– Jag har nyss fått veta att det coronatest som jag har tagit var positivt, säger Misjustin i samband med ett videomöte med landets president Vladimir Putin.
Misjustin föreslår samtidigt att hans biträdande får ta över medan han försätter sig själv i karantän.
Michail Misjustin efterträdde Dmitrij Medvedev som Rysslands premiärminister i januari i år.
Tidigare under dagen kom de aktuella officiella siffrorna från Ryssland och de visade att drygt 7 000 människor har bekräftats smittade av coronaviruset det senaste dygnet, vilket tar antalet rapporterade sjukdomsfall till över 100 000.
Sammanlagt har 1 073 döda och över 106 000 smittade av viruset meddelats från Ryssland, enligt regeringens sajt. Ryssland gick nyligen förbi Iran och Kina i antalet människor som bekräftats sjuka.
I veckan kallade president Vladimir Putin situationen "väldigt svår", samtidigt som han uppgav att spridningen börjat sakta ned.
Vårdanställda i Ryssland har larmat om brist på skyddsutrustning och tester.